Quando um desastre atinge a Terra, um biólogo marinho a bordo de um submarino precisa lutar para sobreviver com a equipe. Para piorar, eles descobrem uma conspiração.
Num mundo pós 2029, cérebros se fundem facilmente a computadores e a tecnologia está em todos os lugares. Motoko Kusanagi é uma ciborgue com experiência militar que comanda um esquadrão de elite especializado em combater crimes cibernéticos.