Num futuro próximo, os humanos serão aprimorados com melhorias cibernéticas em características como visão, força e inteligência. A desenvolvedora de aumento Hanka Robotics estabelece um projeto secreto para desenvolver um corpo artificial, ou “concha”, que pode integrar um cérebro humano em vez de uma IA. Única sobrevivente de um ataque terrorista que matou seus pais, Mira Killian é escolhida como cobaia depois que seu corpo foi danificado sem possibilidade de reparo. Apesar das objeções de seu designer, Dr. Ouelet, o CEO da Hanka Robotics, Cutter, decide usar Killian como um agente antiterrorista. Um ano depois, Killian alcançou o posto de Major na divisão antiterrorista Seção 9 comandada pelo Chefe Daisuke Aramaki, trabalhando ao lado dos agentes Batou e Togusa.